Seperti yang sudah dijelaskan di atas, intoleransi laktosa merupakan gangguan pencernaan dengan kondisi tubuh tidak bisa memproses laktase menjadi glukosa dengan baik. Ini terjadi karena kurangnya enzim laktase dalam usus kecil. Karena kegagalan usus dalam mengurai laktosa, gula alami ini akan ikut terbawa pada usus besar dan difermentasi di sana.

Karena perbedaan sistem pencernaan pada usus kecil dan usus besar, laktosa yang terproses di dalam usus besar berubah menjadi gas dan memicu gangguan pencernaan. Akan tetapi, perlu diketahui, laktosa memang merupakan gula alami yang banyak ditemukan pada susu atau olahan susu, tetapi gangguan pencernaan ini jelas berbeda dengan alergi susu.

Mengutip dari John Hopkins Medicine, intoleransi laktosa merupakan kondisi kegagalan pencernaan dalam memproses laktosa, sedangkan alergi susu merupakan reaksi kekebalan tubuh terhadap protein yang ada pada susu dan menyebabkan alergi.