Varian P1 telah disebabkan oleh sejumlah mutasi, tetapi tiga, khususnya, menjadi perhatian para ilmuwan.

Yang pertama adalah mutasi E484K, yang juga telah diidentifikasi pada varian Afrika Selatan. Ini disebut mutasi “melarikan diri” karena mengubah bagian protein lonjakan virus yang diandalkan oleh sistem kekebalan kita untuk mengenali dan memulai tanggapan kekebalan kita. Perubahan ini mungkin berarti dapat menghindari respons imun yang dipicu oleh vaksin atau infeksi sebelumnya. Diperlukan lebih banyak penelitian untuk memahami ini sepenuhnya.

Protein lonjakan terletak di permukaan luar virus. Ketika virus memasuki tubuh manusia, virus harus masuk ke dalam sel untuk menginfeksi mereka. Ini dilakukan dengan menghubungkan protein lonjakannya ke reseptor di permukaan luar sel manusia, yang disebut reseptor ACE2.

Mutasi E484k telah mengubah protein lonjakan virus asli sehingga lebih mudah mengikat dan membentuk koneksi yang lebih kuat ke sel inang, membuatnya lebih menular. Mutasi yang sama juga berarti virus dapat menghindari antibodi penawar yang dibuat oleh infeksi virus korona sebelumnya dengan lebih efektif. Ini mungkin menjelaskan beberapa infeksi ulang di Manaus.

- Varian N501Y
Yang kedua adalah mutasi N501Y, yang juga hadir pada varian Inggris. Mutasi ini juga memengaruhi protein lonjakan virus korona, tetapi secara khusus "domain pengikat reseptor". Ini adalah bagian dari protein lonjakan yang membuat kontak dengan sel manusia, mengikatnya dan kemudian membiarkan virus masuk. Mutasi ini tidak hanya membuat virus mengikat lebih erat ke sel manusia, tetapi juga membuatnya lebih mungkin untuk tetap terikat padanya, sehingga meningkatkan kemungkinan infeksi. Mutasi ini telah memungkinkan varian Inggris menjadi strain dominan di Inggris dan kemungkinan besar yang membantu varian Brasil menjadi dominan di Manaus.