Gejala infeksi amoeba pemakan otak termasuk sakit kepala parah, demam, mual, muntah, dan leher kaku, dan dapat dimulai antara 1 hingga 12 hari setelah terpapar. Penyakit berkembang dengan cepat setelah gejala dimulai, dan pasien biasanya meninggal dalam waktu 18 hari atau kurang. ***