Bagian dari etos JI berpusat pada keinginan untuk mengubah Indonesia, negara berpenduduk Muslim terbesar di dunia, menjadi sebuah kekhalifahan Islam, yang berarti JI sering menargetkan polisi dan tentara—yang dianggap sebagai simbol negara—dalam serangan mereka.

Sementara pihak berwenang Indonesia telah menggunakan tokoh-tokoh seperti Patek dan Bashir sebagai contoh bagaimana individu dapat dideradikalisasi secara efektif, beberapa tetap skeptis.

Ketika muncul laporan bahwa Patek mungkin mendapatkan pembebasan bersyarat – setelah menjalani 11 tahun dari hukuman 20 tahun – terjadi kegemparan di Australia , rumah bagi 88 orang yang tewas dalam bom Bali. Perdana Menteri Anthony Albanese mengatakan Australia berencana untuk memprotes setiap kemungkinan pembebasan. Warga Australia yang selamat dari pengeboman juga menyatakan ketidakpercayaannya bahwa Patek bisa berhasil dideradikalisasi dalam waktu yang relatif singkat.

Namun para ahli mengatakan deradikalisasi itu rumit dan berbeda untuk setiap orang.

“Kesulitannya adalah tidak ada tinjauan sistematis yang tepat dari studi yang telah dilakukan tentang deradikalisasi Indonesia dan kebanyakan orang melihat sebagian kecil dari upaya deradikalisasi di Indonesia,” Judith Jacob, kepala Asia untuk perusahaan risiko dan intelijen Torchlight , kepada Al Jazeera.

“Istilah deradikalisasi juga sering digabungkan dengan pelepasan dan sangat kabur. Apakah itu berarti bahwa seorang individu melepaskan semua keyakinan dalam ideologi kelompok atau hanya komitmen terhadap kekerasan? Apakah mereka benar-benar meninggalkan jaringan itu dan apa arti reintegrasi ke dalam masyarakat arus utama dalam konteks itu?” dia menambahkan.