Menurut WHO, gejala virus Nipah bervariasi, dari tanpa gejala hingga infeksi saluran pernapasan akut, yang paling buruk adalah ensefalitis, pembengkakan jaringan aktif di otak yang bisa berakibat fatal.
zxc2 
Orang yang terinfeksi mengalami sakit tenggorokan, demam, sakit kepala, dan nyeri otot. 

Awal gejala berkisar antara 4 hingga 14 hari setelah terpapar dan saat ini tidak ada vaksin yang tersedia untuk mengobati pun mencegahnya.