Menurut Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit, virus Nipah pertama kali ditemukan di Malaysia dan Singapura pada 1999 setelah banyak babi dan manusia jatuh sakit.

Virus ini diklasifikasikan sebagai virus zoonosis yang awalnya menyebar dari hewan ke manusia, juga dapat ditularkan melalui makanan yang terkontaminasi dari orang yang terinfeksi.

Virus Nipah tidak memiliki kaitan dengan COVID-19, namun ada kemungkinan berasal dari sumber yang sama, kelelawar.