Sempat Ingin Dirobohkan

Pembangunan masjid sempat berhenti sementara karena krisis moneter, namun kembali dilanjutkan pada 1999. 

Kemudian, Masjid Al Akbar Surabaya diresmikan oleh mantan Presiden Abdurrahman Wahid pada 10 November 2000.   

Salah satu daya tarik Masjid Al Akbar Surabaya, adalah keberadaan kubah masjid yang berbeda dari kubah masjid pada umumnya. 

Masjid Al Akbar Surabaya memiliki kubah besar dan megah berbentuk oval atau setengah telur dengan ketinggian sekitar 27 meter. Kubah oval tersebut didampingi empat kubah kecil lainnya yang berbentuk limasan piramida. 

Kelima kubah Masjid Al Akbar Surabaya tersebut tampak megah dengan warna biru dilengkapi aksen diagonal saling menyilang berwarna hijau muda.